Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV3

Exosc2, Exosome complex component RRP4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc2Q8VBV3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Exosc2Q8VBV3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Exosc2Q8VBV3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms