Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT2

Sds, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdsQ8VBT2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SdsQ8VBT2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SdsQ8VBT2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SdsQ8VBT2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms