Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmx1Q8VBT0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmx1Q8VBT0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms