Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Top1mtQ8R4U6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Top1mtQ8R4U6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Top1mtQ8R4U6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms