Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim29Q8R2Q0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim29Q8R2Q0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms