Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CipcQ8R0W1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CipcQ8R0W1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms