Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F3

Sumf1, Sulfatase-modifying factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumf1Q8R0F3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sumf1Q8R0F3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sumf1Q8R0F3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sumf1Q8R0F3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms