Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxc12Q8K5B8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc12Q8K5B8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc12Q8K5B8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms