Protein–RNA interactions for Protein: Q8K449

Abca9, ATP-binding cassette sub-family A member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca9Q8K449 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abca9Q8K449 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abca9Q8K449 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abca9Q8K449 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abca9Q8K449 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abca9Q8K449 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Abca9Q8K449 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abca9Q8K449 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abca9Q8K449 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abca9Q8K449 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abca9Q8K449 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abca9Q8K449 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abca9Q8K449 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abca9Q8K449 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abca9Q8K449 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abca9Q8K449 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abca9Q8K449 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Abca9Q8K449 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abca9Q8K449 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abca9Q8K449 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abca9Q8K449 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Abca9Q8K449 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Abca9Q8K449 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Abca9Q8K449 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Abca9Q8K449 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Abca9Q8K449 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Abca9Q8K449 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Abca9Q8K449 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Abca9Q8K449 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Abca9Q8K449 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Abca9Q8K449 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Abca9Q8K449 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Abca9Q8K449 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms