Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Q3

Foxn4, Forkhead box protein N4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn4Q8K3Q3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Foxn4Q8K3Q3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxn4Q8K3Q3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms