Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cdk5rap2Q8K389 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms