Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lrrtm1Q8K377 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms