Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ncapd2Q8K2Z4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ncapd2Q8K2Z4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ncapd2Q8K2Z4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ncapd2Q8K2Z4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ncapd2Q8K2Z4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms