Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SrrdQ8K2M3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrrdQ8K2M3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms