Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Abcf3Q8K268 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Abcf3Q8K268 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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