Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nek9Q8K1R7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nek9Q8K1R7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms