Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpne5Q8JZW4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms