Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc4a8Q8JZR6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc4a8Q8JZR6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc4a8Q8JZR6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a8Q8JZR6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a8Q8JZR6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a8Q8JZR6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a8Q8JZR6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a8Q8JZR6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a8Q8JZR6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a8Q8JZR6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc4a8Q8JZR6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 257 ms