Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC7

Klre1, Killer cell lectin-like receptor subfamily E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klre1Q8CJC7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klre1Q8CJC7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klre1Q8CJC7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klre1Q8CJC7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klre1Q8CJC7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klre1Q8CJC7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klre1Q8CJC7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klre1Q8CJC7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Klre1Q8CJC7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Klre1Q8CJC7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Klre1Q8CJC7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Klre1Q8CJC7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Klre1Q8CJC7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Klre1Q8CJC7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Klre1Q8CJC7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klre1Q8CJC7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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