Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip10Q8CJ53 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip10Q8CJ53 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms