Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LgsnQ8CIX8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms