Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nupl2Q8CIC2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nupl2Q8CIC2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms