Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Csnka2ipQ8CH19 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnka2ipQ8CH19 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms