Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbm28Q8CGC6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbm28Q8CGC6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbm28Q8CGC6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rbm28Q8CGC6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbm28Q8CGC6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbm28Q8CGC6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms