Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl1Q8CEQ0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms