Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc17Q8CE13 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc17Q8CE13 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms