Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc178Q8CDV0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms