Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDU5

Efhb, EF-hand domain-containing family member B, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EfhbQ8CDU5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EfhbQ8CDU5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EfhbQ8CDU5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EfhbQ8CDU5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EfhbQ8CDU5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EfhbQ8CDU5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EfhbQ8CDU5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EfhbQ8CDU5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EfhbQ8CDU5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EfhbQ8CDU5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EfhbQ8CDU5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EfhbQ8CDU5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EfhbQ8CDU5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EfhbQ8CDU5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EfhbQ8CDU5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EfhbQ8CDU5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EfhbQ8CDU5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EfhbQ8CDU5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EfhbQ8CDU5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
EfhbQ8CDU5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EfhbQ8CDU5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EfhbQ8CDU5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EfhbQ8CDU5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EfhbQ8CDU5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EfhbQ8CDU5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EfhbQ8CDU5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EfhbQ8CDU5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EfhbQ8CDU5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EfhbQ8CDU5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EfhbQ8CDU5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EfhbQ8CDU5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EfhbQ8CDU5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EfhbQ8CDU5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EfhbQ8CDU5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EfhbQ8CDU5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EfhbQ8CDU5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EfhbQ8CDU5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EfhbQ8CDU5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EfhbQ8CDU5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms