Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Phf20l1Q8CCJ9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phf20l1Q8CCJ9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phf20l1Q8CCJ9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms