Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ufl1Q8CCJ3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ufl1Q8CCJ3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ufl1Q8CCJ3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms