Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RybpQ8CCI5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RybpQ8CCI5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms