Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nrip1Q8CBD1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nrip1Q8CBD1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms