Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrn3Q8CBC6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrn3Q8CBC6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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