Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAI1

Ccdc142, Coiled-coil domain-containing protein 142, mousemouse

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Length 738 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc142Q8CAI1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc142Q8CAI1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc142Q8CAI1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc142Q8CAI1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc142Q8CAI1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc142Q8CAI1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc142Q8CAI1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc142Q8CAI1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc142Q8CAI1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc142Q8CAI1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc142Q8CAI1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc142Q8CAI1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc142Q8CAI1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc142Q8CAI1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc142Q8CAI1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc142Q8CAI1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc142Q8CAI1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc142Q8CAI1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc142Q8CAI1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc142Q8CAI1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc142Q8CAI1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc142Q8CAI1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc142Q8CAI1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc142Q8CAI1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc142Q8CAI1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc142Q8CAI1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc142Q8CAI1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc142Q8CAI1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc142Q8CAI1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc142Q8CAI1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc142Q8CAI1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc142Q8CAI1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc142Q8CAI1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc142Q8CAI1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc142Q8CAI1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc142Q8CAI1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc142Q8CAI1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc142Q8CAI1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc142Q8CAI1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc142Q8CAI1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc142Q8CAI1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms