Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apoa5Q8C7G5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apoa5Q8C7G5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apoa5Q8C7G5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms