Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ssuh2Q8C3L1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssuh2Q8C3L1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms