Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q9

Rapgef5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

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Length 814 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef5Q8C0Q9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rapgef5Q8C0Q9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rapgef5Q8C0Q9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rapgef5Q8C0Q9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Rapgef5Q8C0Q9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rapgef5Q8C0Q9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rapgef5Q8C0Q9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rapgef5Q8C0Q9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef5Q8C0Q9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef5Q8C0Q9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef5Q8C0Q9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef5Q8C0Q9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef5Q8C0Q9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef5Q8C0Q9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef5Q8C0Q9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Rapgef5Q8C0Q9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rapgef5Q8C0Q9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Rapgef5Q8C0Q9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rapgef5Q8C0Q9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rapgef5Q8C0Q9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
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Rapgef5Q8C0Q9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Rapgef5Q8C0Q9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Rapgef5Q8C0Q9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Rapgef5Q8C0Q9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef5Q8C0Q9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef5Q8C0Q9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef5Q8C0Q9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef5Q8C0Q9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Rapgef5Q8C0Q9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef5Q8C0Q9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef5Q8C0Q9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef5Q8C0Q9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef5Q8C0Q9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef5Q8C0Q9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef5Q8C0Q9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef5Q8C0Q9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef5Q8C0Q9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef5Q8C0Q9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef5Q8C0Q9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef5Q8C0Q9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef5Q8C0Q9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef5Q8C0Q9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef5Q8C0Q9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef5Q8C0Q9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rapgef5Q8C0Q9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rapgef5Q8C0Q9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rapgef5Q8C0Q9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms