Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0E3

Trim47, Tripartite motif-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim47Q8C0E3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim47Q8C0E3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim47Q8C0E3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim47Q8C0E3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim47Q8C0E3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim47Q8C0E3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim47Q8C0E3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim47Q8C0E3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim47Q8C0E3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim47Q8C0E3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim47Q8C0E3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim47Q8C0E3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim47Q8C0E3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim47Q8C0E3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim47Q8C0E3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim47Q8C0E3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim47Q8C0E3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms