Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rdh12Q8BYK4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rdh12Q8BYK4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rdh12Q8BYK4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rdh12Q8BYK4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rdh12Q8BYK4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rdh12Q8BYK4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rdh12Q8BYK4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rdh12Q8BYK4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rdh12Q8BYK4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rdh12Q8BYK4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rdh12Q8BYK4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rdh12Q8BYK4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh12Q8BYK4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh12Q8BYK4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms