Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slx1bQ8BX32 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Slx1bQ8BX32 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slx1bQ8BX32 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx1bQ8BX32 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms