Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctdsp2Q8BX07 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms