Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kdm4aQ8BW72 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm4aQ8BW72 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm4aQ8BW72 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms