Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Catsper4Q8BVN3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Catsper4Q8BVN3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms