Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia2Q8BSS9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia2Q8BSS9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia2Q8BSS9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia2Q8BSS9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ppfia2Q8BSS9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfia2Q8BSS9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfia2Q8BSS9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfia2Q8BSS9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfia2Q8BSS9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppfia2Q8BSS9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppfia2Q8BSS9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ppfia2Q8BSS9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ppfia2Q8BSS9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ppfia2Q8BSS9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ppfia2Q8BSS9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia2Q8BSS9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia2Q8BSS9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia2Q8BSS9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia2Q8BSS9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia2Q8BSS9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia2Q8BSS9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia2Q8BSS9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia2Q8BSS9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia2Q8BSS9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia2Q8BSS9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia2Q8BSS9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia2Q8BSS9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppfia2Q8BSS9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppfia2Q8BSS9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms