Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMV6

E130116L18Rik, RIKEN cDNA E130116L18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130116L18RikQ8BMV6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E130116L18RikQ8BMV6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
E130116L18RikQ8BMV6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E130116L18RikQ8BMV6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E130116L18RikQ8BMV6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E130116L18RikQ8BMV6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E130116L18RikQ8BMV6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E130116L18RikQ8BMV6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E130116L18RikQ8BMV6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E130116L18RikQ8BMV6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E130116L18RikQ8BMV6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E130116L18RikQ8BMV6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E130116L18RikQ8BMV6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E130116L18RikQ8BMV6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E130116L18RikQ8BMV6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E130116L18RikQ8BMV6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E130116L18RikQ8BMV6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms