Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp54Q8BL06 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp54Q8BL06 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms