Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnrc6bQ8BKI2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnrc6bQ8BKI2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms