Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Vipas39Q8BGQ1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vipas39Q8BGQ1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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