Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
U2af1l4Q8BGJ9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U2af1l4Q8BGJ9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms