Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Srgap3Q812A2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Srgap3Q812A2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms